Objectifs :

Le cours a pour finalité de donner au biologiste-médecin sans connaissance préalable spécifique du domaine, les bases de la logique (algorithme) de certains logiciels de traitements de séquences et d'analyses génomiques (CGH, Transcriptomes), ainsi qu’une initiation pratique aux logiciels communs disponibles via internet. La démarche du cours est donc progressive (d'abord théorique puis pratique), afin que le biologiste utilise un logiciel dont il aura compris le mode de traitement des données.

Pour cela, une description de la progression historique des algorithmes développés en bioinformatique pour répondre aux questions moléculaires des biologistes sera présentée en cours. Parallèlement, un petit projet d’application sur un exemple de séquence sera réalisé, par binôme, au fur et à mesure des séances sur des PC utilisant Windows (possible également d’utiliser Linux) via des connections internet sur les principaux sites de bioinformatique (NCBI, EBI, Pasteur...).